SMPP Home

PaGL#32_05471 Locus tags: • Sequence Length: 102

Variovorax paradoxus, 2u118 Batch2_genome_fasta/V.paradoxus

5050100100150150
Show complete sequence
Click domain (colored bar) to show sequence
PaGL#32_00195 PaGL#32_05469 PaGL#32_00196 PaGL#32_00197 unknown PaGL#32_00198 PaGL#32_05473 PaGL#32_00199 PaGL#32_00200 
    [PF13377]

    [5:PF13377]

    [1:IPR028082]_[5:IPR046335]

Looking for similar signatures in the working genomes

PF13377:Peripla_BP_3. Periplasmic binding protein-like domain

Found 415 similar signatures
Acetivibrio thermocellus, DSM 1313 WP_003516403.1:LOMAGDGF_00094172-338
WP_003514478.1:LOMAGDGF_00410179-339
WP_003518163.1:LOMAGDGF_02036122-288
WP_003512298.1:LOMAGDGF_02090187-349
Clostridium acetobutylicum, DSM 1731 WP_010966818.1:FHOCHPCF_03606175-335
WP_241428633.1:FHOCHPCF_00404152-311
WP_010963715.1:FHOCHPCF_00436174-337
WP_010964012.1:FHOCHPCF_00739167-329
WP_014518875.1:FHOCHPCF_00903173-330
WP_010964649.1:FHOCHPCF_01393194-358
WP_010966245.1:FHOCHPCF_03009171-334
WP_010966318.1:FHOCHPCF_03083170-333
Acetivibrio alkalicellulosi, DSM 17461 2510060520:NJMEOJLD_00767138-296
2510060599:NJMEOJLD_00846179-339
2510061380:NJMEOJLD_01604180-341
2510062099:NJMEOJLD_02306122-287
2510062451:NJMEOJLD_02649170-334
2510063209:NJMEOJLD_03397121-287
2510063210:NJMEOJLD_03398122-287
2510063568:NJMEOJLD_03746125-283
2510063600:NJMEOJLD_03778123-288
2510063917:NJMEOJLD_04089188-349
Pseudobacteroides cellulosolvens, DSM 2933 WP_242857060.1:NEIHKHHH_0018173-239
WP_242856984.1:NEIHKHHH_00471187-314
WP_152965905.1:NEIHKHHH_00686118-279
WP_050753046.1:NEIHKHHH_00687117-265
WP_036943754.1:NEIHKHHH_01448126-286
WP_036947130.1:NEIHKHHH_02145167-324
WP_036941992.1:NEIHKHHH_03140196-361
WP_036938713.1:NEIHKHHH_03711122-284
WP_050753666.1:NEIHKHHH_04206118-281
WP_036937521.1:NEIHKHHH_04245130-275
WP_036945362.1:NEIHKHHH_05222119-281
WP_050753858.1:NEIHKHHH_05353118-278
Ruminococcus albus_7, DSM 20455 WP_013499691.1:HCIAFFOI_03211194-357
WP_013483915.1:HCIAFFOI_04070168-329
WP_013497065.1:HCIAFFOI_00325125-287
WP_013497204.1:HCIAFFOI_00481123-280
HCIAFFOI_00482186-348
WP_013497227.1:HCIAFFOI_00504129-269
HCIAFFOI_00507108-250
WP_013497393.1:HCIAFFOI_00678166-326
WP_013497549.1:HCIAFFOI_00880121-284
WP_013497972.1:HCIAFFOI_01330140-293
WP_013497974.1:HCIAFFOI_01332124-285
WP_013498121.1:HCIAFFOI_01497125-268
WP_013498135.1:HCIAFFOI_01511126-286
WP_013498347.1:HCIAFFOI_01742111-263
WP_013498504.1:HCIAFFOI_01903130-286
WP_013498567.1:HCIAFFOI_01969171-328
WP_013498571.1:HCIAFFOI_01973129-288
WP_013498604.1:HCIAFFOI_02010124-286
WP_013498605.1:HCIAFFOI_02011127-284
WP_013498884.1:HCIAFFOI_02308135-294
WP_013498886.1:HCIAFFOI_02310134-292
WP_013499056.1:HCIAFFOI_02510187-344
WP_013499203.1:HCIAFFOI_02679171-326
WP_013499224.1:HCIAFFOI_02702126-288
Paenibacillus guangzhouensis, KCTC 33171 WP_152391814.1:KDFAKKPF_00221168-331
WP_152392281.1:KDFAKKPF_00752168-331
WP_152392657.1:KDFAKKPF_01180166-325
WP_152392661.1:KDFAKKPF_01184179-345
WP_193726833.1:KDFAKKPF_01773168-333
WP_152393299.1:KDFAKKPF_01922168-331
KDFAKKPF_02939199-367
WP_152394188.1:KDFAKKPF_02946180-347
WP_193726942.1:KDFAKKPF_030762-60
WP_152394445.1:KDFAKKPF_03247168-328
WP_152394486.1:KDFAKKPF_03303169-328
WP_152394794.1:KDFAKKPF_03658166-325
WP_152395011.1:KDFAKKPF_03902168-330
WP_152395030.1:KDFAKKPF_03933172-332
WP_152395445.1:KDFAKKPF_04455174-335
KDFAKKPF_04602175-332
WP_152397390.1:KDFAKKPF_04648193-359
WP_152395620.1:KDFAKKPF_04655173-339
WP_152396116.1:KDFAKKPF_05249168-331
WP_152396189.1:KDFAKKPF_05333160-318
KDFAKKPF_05834198-367
WP_152396621.1:KDFAKKPF_05837174-331
Clostridium acetobutylicum, ATCC 824 WP_241428633.1:OJAMHIDJ_00404152-311
WP_010963715.1:OJAMHIDJ_00437174-337
WP_010964012.1:OJAMHIDJ_00741167-329
WP_014518875.1:OJAMHIDJ_00906173-330
WP_010964649.1:OJAMHIDJ_01397194-358
WP_010966245.1:OJAMHIDJ_03018171-334
WP_010966318.1:OJAMHIDJ_03092170-333
WP_010966818.1:OJAMHIDJ_03618175-335
Ruminiclostridium herbifermentans MA18, DSM 109966 WP_137697794.1:PROKKA_00538169-335
WP_137698042.1:PROKKA_00809178-337
WP_171003638.1:PROKKA_01324128-269
WP_137696588.1:PROKKA_01397163-325
WP_137696558.1:PROKKA_01430168-333
WP_137696436.1:PROKKA_01568183-345
WP_137696097.1:PROKKA_01946196-361
WP_137697338.1:PROKKA_03396195-340
FD_25_22, AnGL7 AnGL7_00047167-330
AnGL7_00522172-330
AnGL7_00527172-330
AnGL7_00532168-329
AnGL7_00791168-329
AnGL7_01269169-328
AnGL7_01279175-338
AnGL7_03189168-328
AnGL7_03343168-330
FD_25_27, AnGL8 AnGL8_01218179-337
AnGL8_01241168-312
AnGL8_00201173-332
AnGL8_01365170-335
AnGL8_00397179-330
AnGL8_01770168-330
AnGL8_01866168-330
AnGL8_00811169-330
AnGL8_00980168-328
AnGL8_01017168-328
AnGL8_02401167-329
AnGL8_02784170-328
AnGL8_03050167-329
AnGL8_03184179-339
FD_MS_7_1, AnGL28 AnGL28_00097171-330
AnGL28_00416110-269
AnGL28_00897116-274
AnGL28_01295104-262
AnGL28_01406117-272
AnGL28_01412100-258
AnGL28_01708110-259
AnGL28_01709192-341
AnGL28_01778109-269
AnGL28_02012101-256
AnGL28_02021110-270
AnGL28_02034102-259
AnGL28_02137173-335
AnGL28_02827169-314
AnGL28_03088201-359
FD_SO4_25_1_F22, AnGL30 AnGL30_00519174-338
AnGL30_00573109-272
AnGL30_01953196-362
FD_SO4_37_1, AnGL2 AnGL2_00027116-274
AnGL2_00425104-262
AnGL2_00535117-272
AnGL2_00541100-258
AnGL2_00837110-259
AnGL2_00838192-341
AnGL2_00907109-269
AnGL2_01141101-256
AnGL2_01150110-270
AnGL2_01163102-259
AnGL2_01266173-335
AnGL2_01956169-314
AnGL2_02217201-359
AnGL2_02776171-330
AnGL2_03095110-269
FD_YE_25_21, AnGL21 AnGL21_03817208-345
AnGL21_03915167-307
AnGL21_04133169-330
AnGL21_03561177-330
AnGL21_01077167-328
AnGL21_01085167-328
AnGL21_01876173-334
AnGL21_01917173-332
AnGL21_01968174-333
AnGL21_02470168-329
AnGL21_02476174-328
AnGL21_02913167-329
AnGL21_03357168-328
FD_YE_37_3, AnGL26 AnGL26_00121210-330
AnGL26_00317209-373
AnGL26_00849172-335
AnGL26_01459247-311
AnGL26_02791175-340
AnGL26_03220172-334
AnGL26_04290238-332
FD_YE_37_8_2, AnGL3 AnGL3_00385169-331
AnGL3_00758171-333
AnGL3_02765174-336
AnGL3_03564172-335
FD_YE_37_9_2, AnGL4 AnGL4_00436179-320
AnGL4_00491164-324
AnGL4_00557153-316
AnGL4_00671175-334
AnGL4_00743202-370
AnGL4_00896169-332
AnGL4_00964183-347
AnGL4_00967175-343
AnGL4_01017197-357
AnGL4_01106168-328
AnGL4_01434174-341
AnGL4_01472166-325
AnGL4_01653160-319
AnGL4_01811173-340
AnGL4_01821176-335
AnGL4_02195174-334
AnGL4_02745173-332
AnGL4_02753173-338
AnGL4_02759171-334
AnGL4_03413164-324
Terrisporobacter hibernicus, AnGL54 AnGL54_04575166-331
AnGL54_01709164-324
AnGL54_02599175-334
AnGL54_03187172-339
AnGL54_03585167-331
FD-25-21, AnGL21 AnGL21_01809168-329
AnGL21_02096168-329
AnGL21_02107172-330
AnGL21_02573167-330
Sunxiuqinia elliptica, AnGL22 AnGL22_00121210-330
AnGL22_00318209-373
AnGL22_00850172-335
AnGL22_01461247-311
AnGL22_02788175-340
AnGL22_03216172-334
AnGL22_04286238-332
Paraclostridium benzoelyticum, AnGL27 AnGL27_01240171-333
AnGL27_01767175-335
AnGL27_01843174-332
FD-MS-7-8, AnGL9 AnGL9_00140202-359
AnGL9_00513200-328
AnGL9_01881196-326
AnGL9_01914177-337
AnGL9_01939203-334
AnGL9_02254104-262
AnGL9_02444190-319
AnGL9_02468197-326
AnGL9_02496197-331
AnGL9_02505186-326
AnGL9_02572198-339
AnGL9_02592203-337
AnGL9_02620197-342
AnGL9_03016169-297
FD-YE-37-9-3, AnGL29 AnGL29_00003173-332
AnGL29_00011173-338
AnGL29_00017171-334
AnGL29_00671164-324
AnGL29_01161179-346
AnGL29_01216164-324
AnGL29_01282153-316
AnGL29_01396175-334
AnGL29_01468202-370
AnGL29_01621169-332
AnGL29_01689183-347
AnGL29_01692175-343
AnGL29_01742197-357
AnGL29_01831168-328
AnGL29_02159174-341
AnGL29_02197166-325
AnGL29_02378160-319
AnGL29_02536173-340
AnGL29_02546176-335
AnGL29_02920174-334
Methylobacterium radiotolerans, GTSA1 PaGL#34_01554179-346
PaGL#34_03728180-341
PaGL#34_05729172-328
Mucilaginibacter sabulilitoris, SNA2 PaGL#35_01405177-339
PaGL#35_02307174-337
PaGL#35_03003173-336
PaGL#35_03266173-336
PaGL#35_03858166-330
PaGL#35_03969171-337
PaGL#35_03988252-317
PaGL#35_04908173-339
PaGL#35_05309173-335
Variovorax sp., EBFNA2 PaGL#33_00660182-342
PaGL#33_02263188-351
PaGL#33_03952186-347
PaGL#33_03996169-332
PaGL#33_04382180-342
PaGL#33_04908165-327
PaGL#33_05266169-332
Variovorax paradoxus, 2u118 PaGL#32_00135204-365
PaGL#32_054715-98
PaGL#32_05963172-331
PaGL#32_06372172-335
PaGL#32_01234152-314
PaGL#32_02117168-336
PaGL#32_03510175-338
PaGL#32_04596169-332
Maridesulfovibrio salexigens, AnGL23 AnGL23_00672169-330
AnGL23_02736172-335
AnGL23_02894167-329
Exiguobacterium mexicanum, AnGL24 AnGL24_00472175-305
AnGL24_00497169-332
AnGL24_00863174-337
AnGL24_01514168-325
AnGL24_02014172-334
AnGL24_02549200-363
AnGL24_02591172-333
Clostridium subterminale, CB-LS10-1 AnGL53_00165168-329
Priestia megaterium, 10L1 PaGL#57_02313175-331
PaGL#57_02734168-331
PaGL#57_03957195-356
PaGL#57_04035167-329
PaGL#57_04255169-322
PaGL#57_04506174-332
PaGL#57_04690171-337
PaGL#57_05322176-339
PaGL#57_05600168-331
PaGL#57_05872165-327
PaGL#57_06479175-337
PaGL#57_06507163-322
PaGL#57_06773174-336
PaGL#57_06944168-328
PaGL#57_06951170-329
Variovorax paradoxus, SPNA7 PaGL#43_00136190-351
PaGL#43_06319172-335
PaGL#43_01226152-314
PaGL#43_02228168-336
PaGL#43_03549175-338
PaGL#43_04102172-333
PaGL#43_04733169-335
Geodermatophilus sp., RDM14 PaGL#36_00010172-336
PaGL#36_00020170-334
PaGL#36_01217180-331
PaGL#36_02118175-340
Methylorubrum populi, CTY4 PaGL#39_01080166-324
PaGL#39_03529172-328
Fictibacillus phosphorivorans, TY7 PaGL#38_01410161-319
PaGL#38_01834168-332
PaGL#38_01983174-336
PaGL#38_03589169-331
PaGL#38_04300160-322
PaGL#38_04314172-332
PaGL#38_04373160-326
Bacillus subtilis, 30VD-1 PaGL#66_00714170-322
PaGL#66_00837156-315
PaGL#66_00882162-328
PaGL#66_00902192-356
PaGL#66_01313169-336
PaGL#66_01362170-332
PaGL#66_01679165-324
PaGL#66_02085177-338
PaGL#66_02909166-328
PaGL#66_03085132-292
PaGL#66_03112167-329
Peribacillus frigoritolerans, 30N-5 PaGL#67_00324164-321
PaGL#67_00957173-335
PaGL#67_01554166-329
PaGL#67_01800170-333
PaGL#67_02762195-357
PaGL#67_02928170-333
PaGL#67_04447174-335
PaGL#67_04791165-327
PaGL#67_05131179-337
PaGL#67_05227175-337
PaGL#67_05285165-324
Micromonospora inositola, Utrum1 PaGL#61_00957170-333
PaGL#61_01566174-333
PaGL#61_01956186-347
PaGL#61_02712172-342
PaGL#61_02939172-327
PaGL#61_02991181-338
PaGL#61_03007179-338
PaGL#61_03444171-334
PaGL#61_03491177-339
PaGL#61_03606164-323
PaGL#61_03648188-337
PaGL#61_03710164-323
PaGL#61_03759169-330
PaGL#61_04085178-339
PaGL#61_04280173-335
PaGL#61_04363183-340
PaGL#61_04440175-328
PaGL#61_04462176-329
PaGL#61_04586167-332
PaGL#61_04634183-345
PaGL#61_04639194-354
PaGL#61_04640178-339
PaGL#61_04896169-331
PaGL#61_05044168-333
PaGL#61_05964168-350
PaGL#61_06519167-331
PaGL#61_06599180-337
Sphingomonas sp., CR2A3 PaGL#62_00043174-338
PaGL#62_00635193-357
PaGL#62_01170183-345
PaGL#62_01545179-345
PaGL#62_01977170-326
PaGL#62_03191177-338
PaGL#62_03244168-325
PaGL#62_03616172-330
Terrisporobacter hibernicus, CB-LS-10-2 AnGL54_00023172-339
AnGL54_00415167-331
AnGL54_01404166-331
AnGL54_02513164-324
AnGL54_03402175-334
Niallia taxi, AG-1 PaGL#37_04104163-321
PaGL#37_04175178-340
PaGL#37_04297182-338
PaGL#37_04440168-334
PaGL#37_04483178-339
PaGL#37_01011210-372
PaGL#37_01048161-329
PaGL#37_051820-81
PaGL#37_05200166-328
PaGL#37_01702167-329
PaGL#37_02071160-318
PaGL#37_02276168-329
PaGL#37_03081169-331
PaGL#37_03332174-331
PaGL#37_03364167-324
PaGL#37_03377175-338
Mucilaginibacter gossypii, cycad 4 PaGL#42_01409173-336
PaGL#42_02309172-335
PaGL#42_02567173-339
PaGL#42_02808171-337
PaGL#42_03013178-340
PaGL#42_03655174-335
PaGL#42_04730171-333
PaGL#42_05492176-339
Ruminococcus callidus, ATCC 27760 Rcal_00552129-289
Rcal_00819126-256
Rcal_00820186-343
Rcal_01939172-331
Rcal_02090125-288
Rcal_02093125-278
Rcal_02175182-340
Search by locus tag: Search
↑ Top




v4.1 @copyright 2025 UCLA