SMPP Home

PaGL#32_01090 Locus tags: • Sequence Length: 232

Variovorax paradoxus, 2u118 Batch2_genome_fasta/V.paradoxus

5050100100150150200200250250
Show complete sequence
Click domain (colored bar) to show sequence
PaGL#32_01088 PaGL#32_06426 PaGL#32_01089 PaGL#32_06427 PaGL#32_01090 PaGL#32_06428 PaGL#32_01091 PaGL#32_06429 PaGL#32_06430 PaGL#32_01092 
    [SP]_[PF13442]_[PF00034]_[TM]

    [SP]_[41:PF13442]_[144:PF00034]_[TM]

    [SP]_[29:IPR036909]_[40:IPR009056]_[41:IPR009056]_[54:IPR008168]_[132:IPR009056]_[132:IPR036909]_[144:IPR009056]_[194:IPR008168]_[TM]

Looking for similar signatures in the working genomes

PF13442:Cytochrome_CBB3. Cytochrome C oxidase, cbb3-type, subunit III

Found 156 similar signatures
Paenibacillus guangzhouensis, KCTC 33171 WP_227793546.1:KDFAKKPF_0227856-123
WP_152393896.1:KDFAKKPF_0261138-107
WP_152393934.1:KDFAKKPF_02650220-286
WP_152395725.1:KDFAKKPF_0479343-115
WP_227793362.1:KDFAKKPF_0565643-112
FD_25_22, AnGL7 AnGL7_0016862-137
AnGL7_01212281-355
446-520
AnGL7_02593150-225
242-312
FD_MS_7_1, AnGL28 AnGL28_02985371-452
492-578
AnGL28_0347218-91
FD_SO4_37_1, AnGL2 AnGL2_02114371-452
492-578
AnGL2_0260218-91
FD_YE_25_21, AnGL21 AnGL21_0003158-133
AnGL21_0073032-98
AnGL21_01573154-228
242-316
FD_YE_37_3, AnGL26 AnGL26_0014748-132
AnGL26_0026354-135
AnGL26_0065223-96
AnGL26_03119100-182
AnGL26_03133110-184
AnGL26_0328530-100
FD-25-21, AnGL21 AnGL21_00069150-225
242-312
AnGL21_01352281-355
438-512
AnGL21_0245162-137
Sunxiuqinia elliptica, AnGL22 AnGL22_0014848-132
AnGL22_0026454-135
AnGL22_0065323-96
AnGL22_03115100-182
AnGL22_03129110-184
AnGL22_0328130-100
FD-MS-7-8, AnGL9 AnGL9_0078710-83
AnGL9_02874371-452
492-578
Methylobacterium radiotolerans, GTSA1 PaGL#34_0645759-141
PaGL#34_06685328-413
PaGL#34_0670972-153
PaGL#34_06712218-307
PaGL#34_0067792-156
PaGL#34_01211217-308
PaGL#34_0121469-150
PaGL#34_02094316-395
PaGL#34_0267158-136
PaGL#34_0279428-103
PaGL#34_0282228-105
PaGL#34_0384179-142
PaGL#34_0465278-152
PaGL#34_05893117-193
Mucilaginibacter sabulilitoris, SNA2 PaGL#35_0046636-120
PaGL#35_01260100-188
PaGL#35_0359534-114
PaGL#35_0361357-125
PaGL#35_04793491-559
PaGL#35_0527184-164
PaGL#35_06414470-556
Variovorax sp., EBFNA2 PaGL#33_0609479-171
PaGL#33_002441142-1222
PaGL#33_06598100-162
PaGL#33_06602326-411
PaGL#33_00972328-413
PaGL#33_01681129-210
PaGL#33_0189671-153
PaGL#33_0276421-93
PaGL#33_0406642-120
PaGL#33_04939131-206
226-293
PaGL#33_05096295-368
PaGL#33_0552993-168
PaGL#33_05717280-347
PaGL#33_05748624-699
Variovorax paradoxus, 2u118 PaGL#32_002101144-1224
PaGL#32_0573564-156
PaGL#32_0582429-109
PaGL#32_0610761-157
PaGL#32_0109041-119
PaGL#32_0204875-156
PaGL#32_02558130-206
227-293
PaGL#32_0305525-97
PaGL#32_0313644-117
PaGL#32_0399838-108
PaGL#32_04432295-368
PaGL#32_0450636-104
PaGL#32_04614324-410
PaGL#32_0480293-168
PaGL#32_05007612-687
Dietzia cinnamea, 55 PaGL#56_0122267-143
175-249
Maridesulfovibrio salexigens, AnGL23 AnGL23_0287328-93
Exiguobacterium mexicanum, AnGL24 AnGL24_01164250-332
AnGL24_01361182-253
AnGL24_0190643-109
AnGL24_0218839-106
Priestia megaterium, 10L1 PaGL#57_0245643-110
PaGL#57_0301147-115
PaGL#57_03240180-249
Variovorax paradoxus, SPNA7 PaGL#43_002051141-1221
PaGL#43_0574464-156
PaGL#43_0581130-110
PaGL#43_0604561-157
PaGL#43_0108941-119
PaGL#43_0215875-156
PaGL#43_02812130-206
227-293
PaGL#43_0310825-97
PaGL#43_0318944-117
PaGL#43_04007129-218
PaGL#43_0405339-109
PaGL#43_04598295-368
PaGL#43_0467436-104
PaGL#43_04756327-410
PaGL#43_0498193-168
PaGL#43_05205612-687
Geodermatophilus sp., RDM14 PaGL#36_0185482-158
175-249
Methylorubrum populi, CTY4 PaGL#39_0002072-153
PaGL#39_00023219-308
PaGL#39_0119534-112
PaGL#39_0160888-153
PaGL#39_0349255-137
PaGL#39_0402186-160
PaGL#39_0425056-134
PaGL#39_04754304-383
Fictibacillus phosphorivorans, TY7 PaGL#38_02791179-249
PaGL#38_0309541-110
Bacillus subtilis, 30VD-1 PaGL#66_0077739-108
PaGL#66_0177148-116
PaGL#66_02044179-249
Peribacillus frigoritolerans, 30N-5 PaGL#67_0055343-108
PaGL#67_0217950-118
PaGL#67_02414181-249
PaGL#67_0349946-112
Micromonospora inositola, Utrum1 PaGL#61_0377248-123
140-213
PaGL#61_0541562-139
157-231
Sphingomonas sp., CR2A3 PaGL#62_0018077-158
PaGL#62_0357350-139
183-269
MPOB, Sfum 639704010:Sfum_0332066-149
Mucilaginibacter gossypii, cycad 4 PaGL#42_00537195-269
PaGL#42_01859510-578
PaGL#42_0195472-154
PaGL#42_0201238-122
PaGL#42_0214334-96
PaGL#42_02413492-561
PaGL#42_02529189-274
PaGL#42_0355647-117
PaGL#42_03925100-188
PaGL#42_05053483-570

PF00034:Cytochrom_C. Cytochrome c

Found 97 similar signatures
Paenibacillus guangzhouensis, KCTC 33171 WP_152396411.1:KDFAKKPF_05590252-335
FD_25_22, AnGL7 AnGL7_0020832-96
111-198
AnGL7_0045723-100
FD_MS_7_1, AnGL28 AnGL28_02265504-603
AnGL28_02985162-225
FD_SO4_37_1, AnGL2 AnGL2_01394504-603
AnGL2_02114162-225
FD_YE_25_21, AnGL21 AnGL21_0008023-103
115-201
FD_YE_37_3, AnGL26 AnGL26_01178200-311
AnGL26_03125217-314
FD-25-21, AnGL21 AnGL21_0217023-100
AnGL21_0241232-95
111-198
Sunxiuqinia elliptica, AnGL22 AnGL22_01180200-311
AnGL22_03121217-314
FD-MS-7-8, AnGL9 AnGL9_02874162-241
Methylobacterium radiotolerans, GTSA1 PaGL#34_0668559-157
PaGL#34_0084625-120
PaGL#34_0134725-120
PaGL#34_0209444-145
191-298
PaGL#34_02327222-318
PaGL#34_0341422-93
PaGL#34_03515327-422
PaGL#34_0360656-155
PaGL#34_0397477-168
Mucilaginibacter sabulilitoris, SNA2 PaGL#35_00739869-949
PaGL#35_0125634-121
PaGL#35_02282175-261
PaGL#35_0299941-127
PaGL#35_04236217-337
PaGL#35_04611904-985
PaGL#35_0481463-145
PaGL#35_04863200-313
Variovorax sp., EBFNA2 PaGL#33_00244863-962
PaGL#33_0660255-154
PaGL#33_0660325-69
111-197
PaGL#33_00971134-210
PaGL#33_0097250-151
PaGL#33_0104342-104
146-221
PaGL#33_01894223-312
PaGL#33_0189552-139
PaGL#33_01896199-287
PaGL#33_0357629-117
PaGL#33_05211136-213
PaGL#33_0571764-160
PaGL#33_0571924-100
Variovorax paradoxus, 2u118 PaGL#32_00210865-965
PaGL#32_0587825-118
PaGL#32_01090144-219
PaGL#32_02046222-314
PaGL#32_0204742-130
PaGL#32_02048201-289
PaGL#32_0397238-116
PaGL#32_04506136-213
PaGL#32_04613131-216
PaGL#32_0461448-149
204-301
Maridesulfovibrio salexigens, AnGL23 AnGL23_0249336-88
Priestia megaterium, 10L1 PaGL#57_06076256-349
Variovorax paradoxus, SPNA7 PaGL#43_00205862-962
PaGL#43_0585025-118
PaGL#43_01089151-219
PaGL#43_02156226-318
PaGL#43_0215742-130
PaGL#43_02158201-289
PaGL#43_0402840-118
PaGL#43_04674136-213
PaGL#43_0475648-149
204-301
PaGL#43_05311277-366
Methylorubrum populi, CTY4 PaGL#39_0029278-169
PaGL#39_0074123-119
PaGL#39_00780205-323
PaGL#39_02484213-332
PaGL#39_02551326-423
PaGL#39_0351155-156
211-306
324-411
PaGL#39_0475433-133
Fictibacillus phosphorivorans, TY7 PaGL#38_02145252-336
Bacillus subtilis, 30VD-1 PaGL#66_02643258-352
Peribacillus frigoritolerans, 30N-5 PaGL#67_04108264-356
Micromonospora inositola, Utrum1 PaGL#61_03766254-341
PaGL#61_0377139-127
Sphingomonas sp., CR2A3 PaGL#62_0196332-125
PaGL#62_0291469-166
Mucilaginibacter gossypii, cycad 4 PaGL#42_01021756-887
PaGL#42_0140642-127
PaGL#42_0262763-146
PaGL#42_0392934-126
PaGL#42_04950236-356
PaGL#42_05221873-954
Search by locus tag: Search
↑ Top




v4.1 @copyright 2025 UCLA